1、综合科
    负责机关内部事务管理和对外协调，包括文秘综合、人事档案、信息调研、宣传报道、培训专业户、对外接待、后勤保障、工资福利、工作督办、机关财务等工作。
    2、计划财务科
    负责全区农业综合开发中长期规划和年度项目计划的编制、上报和下达；会同有关部门拟定农业综合开发资金管理规章制度、财务会计规章制度和项目资金计划安排方案；会同有关部门办理农业综合开发资金的预、决算和拨、借手续以及有偿资金回收、内部审计、综合统计分析、项目资金使用情况的检查验收等工作。
    3、项目管理科
    拟定并实施农业综合开发项目管理规章制度；负责开发项目的前期评估论证工作，督促项目计划落实，抓好项目实施、检查、验收和建后管护工作；管理农业综合开发项目档案；加强项目库建设；负责做好开发资料统计、管理人员培训及宣传工作。